Однією з функцій центрів контролю та профілактики хвороб є вакцинація.
Згідно з постановою, частина функцій передається з імунопрофілактики центрам контролю та профілактики хвороб (ЦКПХ), а саме: доставка, зберігання, розподіл і дотримання умов холодового ланцюга під час транспортування, зберігання й використання вакцин.
Це потужне посилення системи управління у сфері імунопрофілактики населення. Старе обладнання, зокрема холодильники та морозильні камери, замінені на сучасні холодові кімнати й холодильне обладнання, які відповідають стандартам ВООЗ. Це дозволяє забезпечити повний цикл вакцинації населення та наблизити послуги з імунізації до кожного українця, незалежно від місця перебування.
У спільній координації ЦКПХ з департаментами охорони здоровʼя в кожній області можуть як забезпечувати на постійній основі щеплення для населення в закладах охорони здоровʼя та пунктах щеплень, так і проводити виїзні сесії у віддалених містах і селах.